Anotação Funcional¶
A anotação funcional é o processo de atribuir funções biológicas aos genes previstos nos nossos dados de metagenoma, seja a partir dos contigs montados ou diretamente das reads.
Isso nos ajuda a entender o potencial metabólico da comunidade microbiana.
Pipeline Geral¶
- Mapeamento de Vias Metabólicas: Associação dos genes anotados a vias metabólicas conhecidas para entender os processos bioquímicos que a comunidade pode realizar.
Ferramentas e Bancos de Dados¶
eggNOG-mapper¶
- Descrição: eggNOG-mapper é uma ferramenta para anotação funcional rápida baseada em ortologia. Ela fornece anotações COG (Clusters of Orthologous Groups), KOs do KEGG, e anotações Gene Ontology (GO).
- Comando Exemplo: